هو معهد يهتم بالتاريخ والحضارة والتراث والثقافة القبطية، ويتبع بطريركية الأقباط الأرثوذكس، والرئيس الأعلى للمعهد هو قـداسة الـبـابـا تـواضـروس الـثاني، بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية.

تأسس المعهد سنة 1954م، بأن صدر قرار المجلس الملّي العام بالموافقة على إنشائه في 21 يناير 1954، وقد وافقت وزارة التربية والتعليم على إنشائه بخطابها الصادر من إدارة التعليم العالي رقم 1264 بتاريخ 10 يوليو 1955، والذي أشادت فيه بفكرة إنشائه لخدمة التاريخ الوطني في العصر المسيحي، وسد العجز الموجود في هذا المجال. وفي 17 ديسمبر 1954 أُقيم حفل افتتاح المعهد.. وقابلت الأوساط العلمية العالمية فكرة إنشائه باهتمام بالغ، وسارعت إلى إيفاد علمائها وباحثيها إليه للتعاون العلمي المشترك.

رسالة المعهد واهدافه:

- تُعتبر الرسالة الأولى للمعهد هي البحث العـلمي في مجالات الدراسات القبطية؛ بما فى ذلك دراسة مظاهر الحضارة القبطية بكل جوانبها من: فكر، وتاريخ، ولاهوت، ولغة، وأدب، وفنون، وألحان، وموسيقى، وعمارة، وآثار، ومجتمع، وإعلام، ودراسات إفريقية، وغيرها... والمشاركة والإسهام في مواصلة الكشف عن التراث القبطي المادي وغير المادي، مع العمل على توثيقه وحمايته... والدور التعـليمي في تدريس القبطيات بصورة أكاديمية منتظمة، وتكوين جيل جديد من العلماء والباحثين المتخصصين.. ويمنح المعهد درجات عـلمية في مجال القبطيات (دبلوم دراسات عليا، ماجستير، دكتوراه).. ويهتم المعهد بالدراسات المتخصصة وتشمل عدة مجالات منها العلوم اللاهوتية والكنسية، والعلوم الإنسانية، والدراسات الاجتماعية والتربوية والإعلامية، وغيرها. وكذلك يعمل المعهد على خدمة الكنيسة والمجتمع والوطن، وذلك على أسس روحية، وعلمية، وبحثية، وتطبيقية. ويعمل المعهد على التواصل والتنسيق مع الهيئات العـلمية المحلية والعالمية المتخصصة في مجال الدراسات القبطية.

أقسـام المعهد وتخصصاته: يشتمل المعهد على عشرة أقسام ، كالتالي:

+ قسم علم اللاهوت: ويهدف إلى دراسة العلوم اللاهوتية وفروعها المتعددة، ومنها علوم اللاهوت العقيدي والنظري والأدبي والروحي والرعوي والكتابي والطقسي والمُقارَن وغيرها. ودراسة أسس التفسير السليم للكتاب المقدس. ودراسة المصطلحات والتعبيرات اللغوية اللاهوتية. ودراسة المجامع المسكونية، وكتابات وأقوال الآباء، والحوارات المسكونية وغيرها.

+ قسم اللغة القبطية: ويهدف إلى تعليم اللغة القبطية (قراءة وكتابة وقواعد ومحادثة وترجمة)، ويعمل على الحفاظ على اللغة القبطية وألحانها وصلواتها بالنطق الكنسي السليم، ودراسة قواعدها ولهجاتها وتاريخها وتطورها، والارتباط بينها وبين اللغة المصرية القديمة. ويهتم أيضًا بدراسة الآداب القبطية بكل فروعها، ودراسة نصوص الكتاب المقدس باللغة القبطية، والنصوص الطقسية، والنصوص التاريخية وغيرها. ويُعنى القسم أيضًا بدراسة الصوتيات والخطوط وطرق التدريس، وإعداد دراسات حرة لتعليم اللغة القبطية.

+ قسم الألحان والموسيقى القبطية: يهتم بالألحان والموسيقى القبطية والحفاظ عليها، بما يتطلبه ذلك من دراسة علوم التأليف الموسيقي، والتدوين الموسيقي، والنوتة الموسيقية، مما يساعد الدارسين على تذوق الألحان القبطية، ودراستها وتحليلها وفهم المعاني الروحية لها. كما يمتد الاهتمام إلى دراسة الموسيقى المقارنة، وموسيقى الشعوب الأخرى. ويهتم القسم بالجوانب العملية ومنها جمع الألحان القبطية وتسجيلها، وتكوين فرق لحفظ الألحان (خوارس)، والتعاون مع الهيئات والجامعات الأجنبية لتسجيل وحفظ الألحان القبطية. ويقوم القسم أيضًا بتدريس الألحان في دورات حرة مكثفة، وتقديم بعض الألحان القبطية في رحلات علمية خارج مصر.

+ قسم الفن القبطي: يهتم بدراسة الفنون القبطية بأنواعها مثل الأيقونات وفنون التصوير والزخرفة، وفنون الفريسكو والموزاييك والنحت والخشب والخزف والفخار والزجاج والمعادن والنسيج القبطي. ودراسة مكونات ومحتويات الكنائس كالمذابح والمنجليات وحامل الأيقونات، والنوافذ وزجاجها ورسومها وغيرها. ودراسة فن التصوير الجداري بخاماته وأشكاله المختلفة. ويهتم القسم بالجانب العملي بتدريب الدارسين على الإنتاج الفني في مجالاته المتعددة، بما يشمله من عمليات التحضير وأسلوب الأداء في التصميم والتشكيل والألوان والرموز، وغيرها. ويحرص القسم على نشر نماذج من الفن القبطي محليًا وعالميًا..

+ قسم العمارة القبطية: ويهتم بدراسة العمارة القبطية وعناصرها، مع تحليل خصائصها وتطورها، وما يتطلبه ذلك من دراسة نظريات العمارة، وتاريخ العمارة الكنسية، ودراسة المساحة الأثرية، مع دراسة الطرز المعمارية، وتطورها، ورموزها. ودراسة تاريخ تطور وتصميم المباني الدينية القبطية من الكنائس والأديرة. ودراسة أسس تصميم مباني الكنائس على ضوء الطقس والعقيدة. ويحرص القسم على تعليم الدارسين الطرق الحديثة والمعاصرة لتصميم مبنى الكنيسة القبطية..

+ قسم الآثار القبطية: ويهتم بدراسة الآثار القبطية الثابتة والمنقولة، والحفاظ عليها وتسجيلها وترميمها وصيانتها. ويهتم بدراسة الكنائس والأديرة الأثرية ومحتوياتها من أيقونات ومخطوطات وآثار وغيرها. إلى جانب دراسة بعض العلوم المساعدة ومنها الآثار المصرية القديمة والآثار اليونانية الرومانية، واللغة المصرية القديمة واللغة القبطية. وينظّم القسم رحلات علمية للدارسين للأديرة والكنائس الأثرية بالوجهين البحري والقبلي.

+ قسم التاريخ القبطي: ويهتم بالتاريخ القبطي بجميع عصوره ومراحله، من العصر الرسولي وحتى العصر الحديث، بما في ذلك تاريخ المجامع المسكونية وتاريخ بطاركة الإسكندرية، ودور الأقباط في الأحداث السياسية والاجتماعية والاقتصادية، ودورهم في الحركة الوطنية. ودراسة المخطوطات القبطية.. ويهتم أيضًا بالتاريخ الحديث والمعاصر للكنيسة، كما يهتم القسم بصفة خاصة بتاريخ وحضارة مصر خلال العصر القبطي بكل مظاهرها وجوانبها..

+ قسم الاجتماع والتربية: ويجمع عددًا من التخصصات الاجتماعية اللازمة لدراسة الحياة الاجتماعية بجوانبها المتعددة، وتشمل: علم الاجتماع، والأنثروبولوجيا، والخدمة الاجتماعية، وعلم النفس، والتربية.. ويهتم القسم بمجالات التنمية البشرية والخدمة العملية وتدريب وإعداد الخدام والعاملين في المجالات الكنسية المتعددة..

+ قسم الدراسات الأفريقية: يقدم القسم ثقافة متخصصة عن قارة أفريقيا باعتبارها القارة الأم، ودراسة التأثيرات والمؤثرات الحضارية والثقافية والأدبية والفنية المتبادلة بين مصر والقارة لتنمية معارفهم بها، وتوطيد العلاقات بشعوبها، وتاريخ الكنيسة في افريقيا، وإعداد خدام وباحثين متخصصين. ويهتم بدراسة القارة دراسة متكاملة في خمسة محاور: المحور الاقتصادي والاستثماري والسياسي، المحور الجغـرافي، المحور الأنثروبولوجي، المحور التاريخي، المحور البيئي (الإيكولوجي).

+ قسم الدراسات الإعلامية: ويهدف إلى استخدام المعرفة التكنولوجية والنظريات العلمية الخاصة بمجال الإعلام لخدمة التراث القبطي، ولهذا يتم تدريس نظريات الإعلام، ونشأة وتاريخ وسائل الإعلام وتطورها. وما يتعلق بالعلاقات العامة والتوثيق الإعلامي ونظريات الاتصال، وكيفية استخدامها لخدمة التراث القبطي.

ويجري العمل على إعادة افتتاح قسم الدراسات الشرقية بعد توقفه لفترة طويلة، ويهتم القسم بدراسة تاريخ وتراث وحضارة الكنائس الارثوذكسية الشرقية الشقيقة (السريانية، الأرمنية...)، وكذلك دراسة تراث آبائنا وأجدادنا الأقباط المكتوب باللغة العربية.. وغـيرها.